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黄芩味苦、性寒，有清热燥湿、解毒泻火、止血、安胎等作用。研究表明，黄芩可保肝、解毒及利胆。用黄芩煎剂、黄芩水和醇提取物及黄芩苷，给动物静脉注射可明显增加胆汁的分泌，有利胆作用，黄芩对肝内过氧化脂质（LPO）的形成有抑制作用，对过氧化脂质所致的肝损害，黄芩苷可抑制血清中门冬氨酸氨基转移酶及丙氨酸氨基转移酶增高；黄芩酮对乙醇（酒精）所致的脂肪肝、高脂血症和肝损害均具有改善作用。黄芩用量通常为6〜10克。临床治疗肝病常用的制剂有黄芩苷片、黄芩苷注射液和黄芩素胶囊。
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